191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0115 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0115  uridine kinase  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.54495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  39 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.82 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  37.19 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  33.98 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2916  Uridine kinase  34.1 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000624404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  32.34 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  30.1 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  29.51 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  27.27 
 
 		 219 aa  97.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  31.37 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  31.35 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  31.49 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  30.05 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  31.63 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  26.4 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  32.68 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  29.85 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  27.42 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  29.56 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  31.53 
 
 		 582 aa  89  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  27.87 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  26.34 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  27.32 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  28.49 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  27.17 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  26.78 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  29 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  28.49 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  26.92 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  26.78 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  29.19 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  27.32 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  27.17 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  27.32 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  26.92 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  27.32 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  27.32 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  26.23 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  27.32 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  26.78 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  26.88 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  26.77 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  26.88 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  26.88 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  26.88 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  26.78 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  26.78 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  26.78 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1365  uridine kinase  32 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.759935  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  34.09 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  26.73 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  27.42 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  26.63 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  26.88 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  26.67 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  26.88 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0453  uridine kinase  27.27 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00211906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  28.83 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  25.68 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.78 
 
 		 343 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  25.68 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  26.63 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  31.72 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  31.72 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  26.26 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  26.26 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10398  predicted protein  25.61 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  27.65 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.9 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  27.23 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2200  uridine kinase  27.98 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  27.93 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3961  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.91 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.926817 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  28.97 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  28 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  27.65 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  28.05 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0537  uridine kinase  27.81 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0563702  hitchhiker  0.00000000000000916272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.26 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  28.05 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  26.53 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  28.57 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.03 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_47740  predicted protein  25.84 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0678521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>