More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1934 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 340 aa  691    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  60.06 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.43 
 
 		 321 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.92 
 
 		 323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.04 
 
 		 325 aa  287  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.5 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  46.53 
 
 		 334 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  46 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  47 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3654  phosphoribulokinase  47.5 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  45 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  45 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  45.5 
 
 		 333 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  43.5 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  45.71 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.71 
 
 		 312 aa  179  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  45.14 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3252  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.39 
 
 		 322 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.570797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  40.69 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50773  phosphoribulokinase  40.91 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  35.64 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.83 
 
 		 299 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45513  predicted protein  41.45 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.01 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.43 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2748  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.57 
 
 		 716 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1993  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.14 
 
 		 695 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0026662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  35.71 
 
 		 202 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  34.44 
 
 		 209 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  37.43 
 
 		 204 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  34.64 
 
 		 204 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  32.04 
 
 		 219 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  31.25 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  31.25 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  31.25 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  31.25 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  31.77 
 
 		 213 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  36.67 
 
 		 211 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.53 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  31.25 
 
 		 213 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  33.15 
 
 		 219 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  31.18 
 
 		 213 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  31.18 
 
 		 213 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  31.18 
 
 		 213 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  30.41 
 
 		 213 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.28 
 
 		 205 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  32.42 
 
 		 202 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  33.7 
 
 		 216 aa  89.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  29.17 
 
 		 213 aa  89.4  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  29.69 
 
 		 213 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  31.35 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  29.17 
 
 		 213 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  35 
 
 		 209 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.4 
 
 		 217 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  28.65 
 
 		 213 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  28.65 
 
 		 213 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  29.19 
 
 		 211 aa  86.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  32.42 
 
 		 209 aa  86.3  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  36.09 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2826  phosphoribulokinase  34.02 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000454104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  31.67 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  29.32 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  34.44 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  29.51 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  30.27 
 
 		 211 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  33.51 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  29.51 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  29.89 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  28.87 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4030  Phosphoribulokinase  36.92 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2200  uridine kinase  32.6 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3921  phosphoribulokinase  33.33 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  28.73 
 
 		 504 aa  79.3  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  28.18 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  28.18 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3851  Phosphoribulokinase  35.42 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.392591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  28.04 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  29.9 
 
 		 213 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  28.04 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3782  phosphoribulokinase  33.85 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.161348  normal  0.0134674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  28.04 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  28.04 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  28.04 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3942  putative phosphoribulokinase  33.33 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3699  phosphoribulokinase 1  33.33 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0254  phosphoribulokinase  33.33 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  32.52 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  32.52 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  27.75 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0562  phosphoribulokinase  32.82 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000247732  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  29.94 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>