276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0113 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 
312 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  89.1 
 
 
313 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  72.4 
 
 
311 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  73.55 
 
 
313 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  49 
 
 
315 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  47.21 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3252  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.31 
 
 
322 aa  261  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.570797  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.71 
 
 
340 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  35.82 
 
 
334 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.97 
 
 
299 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  35.85 
 
 
332 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  35.85 
 
 
332 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.6 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  38.92 
 
 
334 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.8 
 
 
323 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  38.19 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3654  phosphoribulokinase  37.16 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.2 
 
 
343 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  34.27 
 
 
333 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  37.19 
 
 
333 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.43 
 
 
321 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.57 
 
 
321 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.55 
 
 
291 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45513  predicted protein  29.72 
 
 
381 aa  145  9e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011186  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50773  phosphoribulokinase  29.96 
 
 
396 aa  142  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2748  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.6 
 
 
716 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1993  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.47 
 
 
695 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0026662 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  32.42 
 
 
232 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  30.27 
 
 
204 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.27 
 
 
219 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  31.87 
 
 
232 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  27.22 
 
 
209 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  31.84 
 
 
202 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  29.83 
 
 
204 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  28.57 
 
 
219 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  31.18 
 
 
213 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  31.02 
 
 
216 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  31.35 
 
 
208 aa  90.9  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  30.81 
 
 
213 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  27.62 
 
 
211 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  30.94 
 
 
202 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.57 
 
 
205 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  30.81 
 
 
212 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  28.96 
 
 
209 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  28.73 
 
 
209 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  30.11 
 
 
213 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  26.88 
 
 
213 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  30.59 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  29.73 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  29.35 
 
 
211 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  28.11 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  29.19 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  28.11 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  28.11 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  32.43 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  29.57 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0382  uridine kinase  30.98 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0215949  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  29.63 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  29.57 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  32.14 
 
 
207 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  27.89 
 
 
582 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  28.8 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.67 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  28.02 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  31.02 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  28.96 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  28.19 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  28.34 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  29.41 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  28.8 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  29.73 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  29.73 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  29.73 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  29.73 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  29.03 
 
 
209 aa  77  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  30.27 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  27.81 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  27.78 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  28.14 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  28.14 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  28.8 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  28.8 
 
 
212 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  28.8 
 
 
212 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  29.57 
 
 
215 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  27.32 
 
 
220 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  26.19 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  28.8 
 
 
212 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>