247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0794 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 323 aa  669    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.92 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.12 
 
 		 321 aa  301  8.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.65 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.85 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.57 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  44.12 
 
 		 334 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  47.19 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  46.46 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  47.19 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  47.19 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  43.63 
 
 		 333 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  41.08 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  39.77 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  41.58 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  41.46 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3654  phosphoribulokinase  47.75 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.8 
 
 		 312 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  41.8 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.51 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3252  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.54 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.570797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.98 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50773  phosphoribulokinase  38.89 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45513  predicted protein  33.99 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.62 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2748  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.27 
 
 		 716 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1993  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.14 
 
 		 695 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0026662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.7 
 
 		 217 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.35 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  30.9 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  32.42 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.61 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  27.87 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  32.6 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  28.96 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  30.9 
 
 		 202 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  37.07 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3921  phosphoribulokinase  32.18 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  30.11 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2826  phosphoribulokinase  29.84 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000454104  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  29.73 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  28.11 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  29.57 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  28.12 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  28.49 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  28.49 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  28.49 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  30.16 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3627  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.16 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.694975  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  30.56 
 
 		 209 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  31.52 
 
 		 202 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  28.49 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  28.49 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  32.07 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1512  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.25 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000087167  decreased coverage  0.0000773868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  26.34 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  27.57 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  25.56 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0920  Phosphoribulokinase  32.14 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  27.57 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  26.88 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  26.92 
 
 		 211 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  26.56 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  26.56 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0944  Phosphoribulokinase  31.63 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  26.56 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  27.47 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1864  phosphoribulokinase  29.61 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.712466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  29.1 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  26.56 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0980  phosphoribulokinase  31.12 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  30.22 
 
 		 211 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  32.42 
 
 		 211 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  26.04 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0789  phosphoribulokinase  29.95 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0104023  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  26.04 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  26.04 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  26.04 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0193  phosphoribulokinase  29.25 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0908262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0115  uridine kinase  28.42 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.54495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  27.47 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1983  phosphoribulokinase  30.21 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3558  phosphoribulokinase  30.15 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>