More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0977 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  100 
 
 
333 aa  689    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  78.68 
 
 
333 aa  565  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  78.61 
 
 
334 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3654  phosphoribulokinase  79.32 
 
 
336 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  76.81 
 
 
334 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  76.51 
 
 
334 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  79.69 
 
 
332 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  79.69 
 
 
332 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45513  predicted protein  58.55 
 
 
381 aa  448  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011186  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50773  phosphoribulokinase  55.82 
 
 
396 aa  395  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.13 
 
 
321 aa  192  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  47 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.26 
 
 
325 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.88 
 
 
321 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3252  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.07 
 
 
322 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.570797  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.07 
 
 
343 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  35.64 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.77 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  43.09 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  45 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  36.86 
 
 
311 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  41.08 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.99 
 
 
315 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.27 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1993  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.87 
 
 
695 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0026662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2748  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.78 
 
 
716 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.16 
 
 
291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.6 
 
 
433 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  38.12 
 
 
209 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  34.05 
 
 
213 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  34.05 
 
 
213 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  34.05 
 
 
213 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  34.05 
 
 
213 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  34.05 
 
 
213 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  34.04 
 
 
213 aa  99.4  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  31.11 
 
 
209 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  31.61 
 
 
202 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  32.98 
 
 
213 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.435743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  34.59 
 
 
213 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.58 
 
 
217 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  28 
 
 
204 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  35 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  32.58 
 
 
212 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  32.63 
 
 
211 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  31.89 
 
 
212 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  31.77 
 
 
211 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  34.41 
 
 
211 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  28.7 
 
 
232 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  28.7 
 
 
232 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  28.33 
 
 
202 aa  92.8  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  32.45 
 
 
213 aa  92.4  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  32.45 
 
 
213 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  32.45 
 
 
213 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  36.09 
 
 
236 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  32.63 
 
 
212 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  32.98 
 
 
213 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  32.63 
 
 
212 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  32.63 
 
 
212 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  32.63 
 
 
212 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  32.11 
 
 
213 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  30.56 
 
 
209 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  28.89 
 
 
504 aa  90.5  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  31.89 
 
 
212 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  33.15 
 
 
218 aa  89.7  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  31.61 
 
 
216 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.21 
 
 
205 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  32.11 
 
 
219 aa  89.7  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  33.88 
 
 
211 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  32.11 
 
 
212 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  30.37 
 
 
219 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  31.38 
 
 
211 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  32.11 
 
 
212 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  32.11 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  32.11 
 
 
212 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  33.33 
 
 
204 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  32.11 
 
 
212 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  31.38 
 
 
213 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  32.43 
 
 
212 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  32.93 
 
 
208 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  27.47 
 
 
219 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  33.14 
 
 
208 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  31.58 
 
 
212 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  28.89 
 
 
207 aa  85.9  9e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  27.6 
 
 
526 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  33.15 
 
 
201 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  32.24 
 
 
215 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  33.33 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  31.02 
 
 
212 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  30.81 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  30.81 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2200  uridine kinase  33.15 
 
 
223 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  31.78 
 
 
210 aa  82  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>