79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0450 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0450  uridine kinase-like protein  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05090  hypothetical protein  60.21 
 
 		 212 aa  250  8.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  54.26 
 
 		 354 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0374  Uridine kinase-like protein  53.93 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3297  ATP-binding protein  50.27 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  decreased coverage  0.000867237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3531  uridine kinase  46.91 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268098  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08140  uridine kinase  47.95 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.982733  normal  0.431984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5273  Uridine kinase-like protein  41.18 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10560  uridine kinase  36.69 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.177054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  27.1 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  29.88 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  31.82 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  31.82 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  31.82 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  31.82 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  30.72 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  29.3 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  29.61 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  30.72 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  28.57 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0388  uridine kinase  28.67 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00997727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  29.38 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  31.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  31.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  31.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  29.41 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  28.86 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  23.42 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  26 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  27.63 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  28.76 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  29.22 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10701  uridine kinase  27.81 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0555332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  31.82 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  27.43 
 
 		 552 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  27.27 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  28.16 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  24.69 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  28.3 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  28.3 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0995  uridine kinase  25.16 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0443185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  22.28 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  31.79 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.17 
 
 		 559 aa  45.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  33.33 
 
 		 557 aa  45.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  28.81 
 
 		 549 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  22.81 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  31.03 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.19 
 
 		 555 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  22.81 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  26.96 
 
 		 547 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  26.17 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  23.75 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  24.24 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  24.84 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  24.84 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  24.84 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  25.49 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  25.49 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  25.49 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  25.49 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  29.57 
 
 		 526 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  23.35 
 
 		 554 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  25.49 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  23.98 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  23.91 
 
 		 208 aa  42  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  24.49 
 
 		 198 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201971  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.39 
 
 		 555 aa  41.2  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.24 
 
 		 558 aa  41.2  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.39 
 
 		 555 aa  41.2  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>