82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0995 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0995  uridine kinase  100 
 
 		 197 aa  380  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0443185  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  72.45 
 
 		 198 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201971  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  72.45 
 
 		 198 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10681  ATP/GTP-binding motif-containing protein  50.27 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0388  uridine kinase  38.51 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00997727  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10701  uridine kinase  37.63 
 
 		 202 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0555332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  24.12 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  25.44 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  25.79 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  29.03 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  24.69 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  27.49 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  27.49 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  31.41 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  28.93 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  24.56 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  29.41 
 
 		 232 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  29.41 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  28.82 
 
 		 504 aa  51.6  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  29.31 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  24.74 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  24.4 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  25.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  23.95 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  23.08 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  25.31 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  25.15 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  30.38 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  30.38 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  27.92 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  24.4 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  24.4 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  24.4 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  24.4 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  23.95 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  25.52 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  28.33 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  23.95 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  23.95 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.67 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  29.79 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  24.4 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  26.37 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0450  uridine kinase-like protein  25.16 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  31.36 
 
 		 551 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.36 
 
 		 555 aa  45.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  25.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  31.36 
 
 		 552 aa  44.7  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  28.48 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  29.11 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  30.51 
 
 		 551 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  29.11 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  21.95 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  23.08 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  25.16 
 
 		 526 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  22.75 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  27.15 
 
 		 582 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  29.01 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  22.49 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  21.58 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  22.02 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  25.33 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  28.81 
 
 		 240 aa  42  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  30.28 
 
 		 204 aa  42  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  23.72 
 
 		 212 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  43.9 
 
 		 557 aa  42  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  24.05 
 
 		 211 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  28.75 
 
 		 214 aa  42  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0052  uridine kinase-like  22.12 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  24.05 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  24.05 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  24.05 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  24.05 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  25.79 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>