37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0204 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  307  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  56.25 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  54.32 
 
 		 199 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  52.83 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  45.57 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  40.49 
 
 		 203 aa  90.5  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  40.62 
 
 		 210 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  40.24 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  42.68 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  36.77 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  37.34 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  37.06 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  32.89 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  36.49 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  36.49 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  36.49 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  28.97 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  34.15 
 
 		 682 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  30.67 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  27.47 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  35.67 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  35.4 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.33 
 
 		 719 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  30.25 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  30.71 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  31.74 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  21.47 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  32.28 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  32.28 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  28.03 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10701  ATP/GTP-binding motif-containing protein  24.14 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  32.14 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  23.66 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.89 
 
 		 567 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0995  uridine kinase  22.75 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0443185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.81 
 
 		 205 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>