57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4007 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  354  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  62.73 
 
 		 188 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  56.25 
 
 		 156 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  54.37 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  39.52 
 
 		 193 aa  95.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  43.93 
 
 		 221 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  40.66 
 
 		 340 aa  87.8  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  35.37 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  35.33 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  29.05 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  35.5 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  29.05 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  34.1 
 
 		 682 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  34.87 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.62 
 
 		 719 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  32.08 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  29.71 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  33.53 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  33.53 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  33.53 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  24.32 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  34.88 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  34.88 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  32.95 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  28.68 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  32.39 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  32.14 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  32.75 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0392  putative type II protein secretion system E protein CtsE  26.09 
 
 		 504 aa  45.1  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0117  twitching motility protein  31.34 
 
 		 370 aa  44.7  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  37.25 
 
 		 366 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  39.22 
 
 		 349 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  39.22 
 
 		 349 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  30.41 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  22.38 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  30.67 
 
 		 568 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  35.29 
 
 		 366 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  35.29 
 
 		 368 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  31.88 
 
 		 397 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  35.76 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  40 
 
 		 360 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  32.39 
 
 		 378 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5635  ABC transporter ATP-binding protein  30.25 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.15 
 
 		 321 aa  42  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  44.74 
 
 		 549 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.17 
 
 		 462 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  23.91 
 
 		 557 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  33.33 
 
 		 365 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64870  ABC transporter ATP-binding protein  30.43 
 
 		 290 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00483294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  30.88 
 
 		 560 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  38 
 
 		 349 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  22.63 
 
 		 215 aa  41.2  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  31.88 
 
 		 350 aa  40.8  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  31.88 
 
 		 350 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  34 
 
 		 374 aa  40.8  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  36.54 
 
 		 345 aa  40.8  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  22.63 
 
 		 229 aa  40.8  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>