49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4667 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  42.71 
 
 
193 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  40.5 
 
 
221 aa  121  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  40.21 
 
 
340 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  40 
 
 
199 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  38.73 
 
 
210 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  32.47 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  35.48 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  35.98 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  36.02 
 
 
682 aa  88.6  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  33.52 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.62 
 
 
719 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  34.83 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  34.16 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  34.16 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  34.16 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  35.37 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  35.06 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  34.52 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  29.8 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  33.13 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  26.82 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  25.7 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  30.67 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  36.97 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  26.86 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  33.73 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  25 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  32.24 
 
 
195 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  27.15 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  25.7 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  25.7 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  25.7 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  29.28 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  29.28 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  26.52 
 
 
223 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  25.7 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  25.7 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  28.88 
 
 
207 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  25.14 
 
 
223 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  28.27 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  25.13 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  21.02 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  25.17 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  28.87 
 
 
268 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  26.71 
 
 
229 aa  41.6  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1674  pantothenate kinase  30.77 
 
 
283 aa  41.2  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0576097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>