78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4128 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  79.63 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  60.45 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  43.98 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  43.5 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  47.03 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  47.15 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  35.38 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  34.87 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  34.36 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  33.85 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  34.36 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  34.36 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  34.18 
 
 		 220 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  34.36 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  45.13 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  38.12 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  43.11 
 
 		 164 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  36.82 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  27.46 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  41.84 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  26.42 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  34.11 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  35.1 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  30.77 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  27.51 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  31.14 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  25.14 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  31.46 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  29.33 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  39.36 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  24.12 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  32.96 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  29.59 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  24.14 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  23.27 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  22.39 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  27.46 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  22.39 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  24.87 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  23.27 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  23.92 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  23.92 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  26.42 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  32.12 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  28 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  28.96 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  22.39 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0995  uridine kinase  23.08 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0443185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  30.61 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  27.84 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  25.24 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  21.89 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  26.6 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  26.6 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  32.45 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  24.49 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  29.41 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  29.41 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  25.78 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  25.4 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  32.43 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  26.37 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  26.37 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  31.72 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  32.2 
 
 		 318 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  31.36 
 
 		 318 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  24.87 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  25.13 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  31.36 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.64 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  31.36 
 
 		 318 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2748  uridine kinase  24.14 
 
 		 193 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942955  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  31.32 
 
 		 322 aa  42.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  22.92 
 
 		 526 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>