214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0062 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  99.57 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  84.98 
 
 
213 aa  370  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  50.99 
 
 
206 aa  201  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  51.27 
 
 
211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  52.94 
 
 
198 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  52.45 
 
 
198 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  54.08 
 
 
198 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  44.9 
 
 
210 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  45.63 
 
 
237 aa  171  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  47.59 
 
 
217 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  41.79 
 
 
210 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  48.74 
 
 
204 aa  165  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  46.63 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  42.56 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  42.11 
 
 
217 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  40.51 
 
 
205 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.86 
 
 
207 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  39.72 
 
 
213 aa  134  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  41.5 
 
 
219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  38.69 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  43.81 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  40.2 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  41.08 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  41.5 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  41.21 
 
 
213 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  40.19 
 
 
224 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  39.9 
 
 
215 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  38.42 
 
 
216 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.78 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  37.31 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.98 
 
 
208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  38.69 
 
 
210 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  37.44 
 
 
213 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  39.11 
 
 
210 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.16 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.16 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  38.62 
 
 
212 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  36.41 
 
 
211 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  32.89 
 
 
226 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  37.23 
 
 
229 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  34.57 
 
 
237 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 
237 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 
237 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  34.57 
 
 
237 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 
237 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  30.96 
 
 
240 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  37.57 
 
 
261 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  38.22 
 
 
215 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  36.98 
 
 
226 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.63 
 
 
226 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  34.36 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  35.52 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  34.36 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  34.69 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  34.9 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  32.81 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.83 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  34.2 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  30.05 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  30.85 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  31.34 
 
 
244 aa  85.5  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  30.48 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  31.25 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 
583 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  30.06 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  28.93 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  29.94 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  27.78 
 
 
318 aa  68.2  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  30.63 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  27.78 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  31.87 
 
 
320 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  30.82 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  35 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  28.57 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2622  pantothenate kinase  26.5 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.345143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  29.49 
 
 
330 aa  65.1  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  26.92 
 
 
343 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  23.86 
 
 
307 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  28 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  29.75 
 
 
328 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  23.86 
 
 
287 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  28.33 
 
 
336 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  27.22 
 
 
318 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  29.75 
 
 
358 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  29.3 
 
 
319 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  27.06 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  25.5 
 
 
305 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  30.19 
 
 
318 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  29.52 
 
 
307 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  27.37 
 
 
316 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  29.94 
 
 
309 aa  62  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  29.75 
 
 
316 aa  62  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  25.13 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  31.33 
 
 
329 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  30.07 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  32.17 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  25.16 
 
 
330 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  27.39 
 
 
329 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  27.67 
 
 
318 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>