25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2744 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  63.46 
 
 
248 aa  136  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  41.84 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  41.11 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  41.05 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  41.75 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  36.26 
 
 
231 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  40.86 
 
 
234 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  31.73 
 
 
223 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  34.74 
 
 
207 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  30.77 
 
 
223 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  30.77 
 
 
223 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  31.73 
 
 
223 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  30.69 
 
 
223 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  30.3 
 
 
223 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  30.93 
 
 
221 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  34.48 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  28.57 
 
 
220 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  21.25 
 
 
231 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  21.25 
 
 
231 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  21.69 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  37.93 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  20.99 
 
 
198 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  25 
 
 
209 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  19.75 
 
 
198 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>