58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6545 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  100 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  43.5 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  42.47 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  44.39 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  45.02 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  48.26 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  37.27 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  36.07 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  37.98 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  35.62 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  35.62 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  35.62 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  35.62 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  40.91 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  63.46 
 
 		 105 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  34.96 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  35.71 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  57.43 
 
 		 154 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  38.55 
 
 		 164 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  32.43 
 
 		 223 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  33.87 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  37.12 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  36.8 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  30.46 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  26.6 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  26.6 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  32.51 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  28.25 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  40.22 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  27.23 
 
 		 209 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  36.97 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  24.19 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  32.76 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  23.66 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  25.44 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  23 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  23 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  28.92 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  25.27 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  25.27 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  23.12 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  25.53 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  23.12 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  23.12 
 
 		 193 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  23.12 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5598  histidinol-phosphate phosphatase family protein  27.94 
 
 		 649 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  27.15 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  27.61 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  31.08 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  27.95 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  24.44 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2748  uridine kinase  24.19 
 
 		 193 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  24.19 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  25.12 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  29.41 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  25.61 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  32.86 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>