25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  410  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  63.24 
 
 
209 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  50.48 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  53.69 
 
 
206 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  52.45 
 
 
202 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  48.06 
 
 
208 aa  154  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  47.12 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  41.84 
 
 
209 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  37.25 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  31.14 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  30.46 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  32.38 
 
 
268 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  26.77 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  31.61 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  32.68 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  28.21 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  24.62 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  23.71 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  24.87 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  24.87 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  23.72 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  24.37 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  22.68 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  28.71 
 
 
164 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  23.08 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>