28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  397  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  54.37 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  44.17 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  48.06 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  50.96 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  48.54 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  44.29 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  43.92 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  39.9 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  31.25 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  32.82 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  21.36 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  23.04 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  23.04 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  24.76 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  22.71 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  21.57 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  21.57 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  29.59 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  21.57 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  26.85 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  21.08 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  27.74 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  25.68 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  29.7 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  30.88 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  41.77 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  29.56 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>