47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2980 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  35.48 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  38.5 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  35.02 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  34.56 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  35.02 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  35.02 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  34.56 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  35.71 
 
 
223 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  38.12 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  34.56 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  40.7 
 
 
225 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  38.5 
 
 
268 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  35.71 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  37.67 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  36.32 
 
 
222 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  36.02 
 
 
164 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  34.88 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  35.38 
 
 
207 aa  95.9  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  41.05 
 
 
105 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  26.98 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  26.26 
 
 
189 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  24.87 
 
 
198 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  26.85 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  23.12 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  22.93 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  22.93 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  22.49 
 
 
193 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  33.62 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  26.75 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  26.35 
 
 
208 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  23.41 
 
 
193 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  22.93 
 
 
193 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  32.06 
 
 
202 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  30.12 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  22.93 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  21.53 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  21.53 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  27.61 
 
 
209 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  32.2 
 
 
206 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  25.67 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  23.42 
 
 
504 aa  46.6  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  21.7 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5598  histidinol-phosphate phosphatase family protein  27.91 
 
 
649 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  48.94 
 
 
154 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.12 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  27.01 
 
 
229 aa  42  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>