66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4970 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  100 
 
 		 268 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  76.86 
 
 		 230 aa  332  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  58.21 
 
 		 225 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  45.02 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  42.79 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  45.7 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  47.09 
 
 		 222 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  36.96 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  36.76 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  35.87 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  36.41 
 
 		 223 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  35.87 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  36.41 
 
 		 223 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  36.41 
 
 		 223 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  38.5 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  45.18 
 
 		 207 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  35.33 
 
 		 221 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  42.31 
 
 		 164 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  37.9 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  41.11 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  26.06 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  26.06 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  24.63 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  33.56 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  35 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  28.35 
 
 		 195 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  32.38 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  31.61 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  34.97 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  23.84 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  38.54 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  57.41 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  24.3 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  23 
 
 		 193 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  23 
 
 		 193 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  25.13 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  38 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  24.27 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  24.27 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  22.12 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  23.41 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  23 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  28.49 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  23.61 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  33.74 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  33.74 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  21.66 
 
 		 193 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  29.7 
 
 		 208 aa  48.9  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  30.57 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  23.98 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  32.43 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  27.54 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  23.3 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  32.35 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  29.93 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  27.98 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  31.97 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  24.88 
 
 		 202 aa  45.8  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  34.51 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  23.2 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  24.74 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  28.19 
 
 		 232 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  28.19 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  31.33 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  30.77 
 
 		 199 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.79 
 
 		 233 aa  42  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>