269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0237 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  100 
 
 
198 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  85.86 
 
 
198 aa  329  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  85.35 
 
 
198 aa  328  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  53.4 
 
 
213 aa  188  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  51.96 
 
 
206 aa  185  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  54.08 
 
 
232 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  54.7 
 
 
204 aa  175  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  51.26 
 
 
211 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  53.57 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  54.4 
 
 
217 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  47 
 
 
210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  47.72 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  47.32 
 
 
237 aa  160  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  43.48 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  45.74 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  44.56 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  50.36 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  45.7 
 
 
221 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  41.49 
 
 
217 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  40.59 
 
 
213 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  41.8 
 
 
238 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  40.1 
 
 
212 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  39.27 
 
 
213 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  39.2 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  40.74 
 
 
238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  40.93 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  43.37 
 
 
211 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  46.31 
 
 
211 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.99 
 
 
207 aa  111  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  43.11 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  44.38 
 
 
205 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  39.41 
 
 
216 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.79 
 
 
193 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  39.2 
 
 
212 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  40.46 
 
 
216 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.92 
 
 
208 aa  104  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  40.21 
 
 
237 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  40.1 
 
 
210 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  39.57 
 
 
237 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  39.57 
 
 
237 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  39.57 
 
 
237 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  39.57 
 
 
237 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  39.57 
 
 
237 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.64 
 
 
226 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.64 
 
 
226 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  38.83 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  41.85 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  38.17 
 
 
237 aa  99  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  39.15 
 
 
237 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  33.5 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  39.67 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  37.23 
 
 
215 aa  94.7  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.2 
 
 
199 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.79 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  38.17 
 
 
261 aa  90.9  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  38.38 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  39.01 
 
 
226 aa  88.2  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  29.38 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 
583 aa  81.6  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  32.6 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.87 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  39.31 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2526  pantothenate kinase  31.48 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  31.06 
 
 
326 aa  74.7  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  32.05 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  30.63 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  23.21 
 
 
306 aa  71.2  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  28.99 
 
 
330 aa  71.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  28.9 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0851  pantothenate kinase  26.97 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00289921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  29.3 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  26.98 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  28.74 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  30.82 
 
 
315 aa  68.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  29.3 
 
 
312 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  32.24 
 
 
310 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  32.52 
 
 
309 aa  67.8  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  28.83 
 
 
375 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  26.22 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  32.87 
 
 
314 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.52 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  26.99 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  32.69 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  28.98 
 
 
316 aa  65.5  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3622  pantothenate kinase  28.83 
 
 
322 aa  65.1  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  30.54 
 
 
329 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  26.67 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  29.19 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  26.67 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  26.67 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  32.4 
 
 
328 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  31.03 
 
 
343 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  29.33 
 
 
312 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  30.26 
 
 
312 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  30.26 
 
 
312 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  25.93 
 
 
287 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  26.7 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  30.26 
 
 
312 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  28.57 
 
 
316 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0202  pantothenate kinase  25.44 
 
 
316 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>