83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2803 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  100 
 
 		 212 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  45.7 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  42.47 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  43.33 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  36.94 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  37.79 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  37.06 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 		 583 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  36.81 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  40.1 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  37.88 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  36.87 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  39.2 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  39.47 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  37.7 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  33.51 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.34 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  37.44 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  35.2 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  34.18 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  33.51 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  34.05 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.16 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  32.5 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  31.41 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  37.23 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  32.64 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  34.39 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  32.79 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  34.16 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.99 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  34.62 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  35.52 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  31 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  35.52 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  31.09 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.63 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  32 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  33.7 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  34.46 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  34.46 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  34.46 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  34.46 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  34.46 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  33.71 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  30.17 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  31.05 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  31.72 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  34.07 
 
 		 237 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  32.97 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  32.97 
 
 		 237 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  30.73 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  29.74 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  32.97 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  30.9 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  32.97 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  32.97 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  33.7 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.43 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.43 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.82 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  31.91 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  28.93 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  28.57 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  30.26 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  28.21 
 
 		 318 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  28.21 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  31.85 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.78 
 
 		 433 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  31.11 
 
 		 333 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  31.85 
 
 		 334 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  33.8 
 
 		 455 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  26.47 
 
 		 627 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1826  ATPase central domain-containing protein  26.67 
 
 		 307 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  24.16 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.23 
 
 		 315 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.52 
 
 		 299 aa  42  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  30.37 
 
 		 333 aa  42  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  30.37 
 
 		 332 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  30.37 
 
 		 332 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>