148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  59 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  58.13 
 
 		 211 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  57.21 
 
 		 210 aa  217  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  57.79 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  59.9 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  54.77 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  58.82 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.5 
 
 		 207 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  49.75 
 
 		 219 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  53.96 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  56.5 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  48.26 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  53.57 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  58.99 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.12 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  52.58 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  53.44 
 
 		 213 aa  177  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  47.55 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  50.72 
 
 		 228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  164  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  46.8 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.83 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.88 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.55 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.55 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  43.39 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.07 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  37.25 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  45.83 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  43.96 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  35.75 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  37.31 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  37.31 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  31.63 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  38.83 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  40.62 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  38.5 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.71 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  33.84 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  40 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  37.93 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  46.31 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  44.83 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  44.83 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  33.84 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  33.33 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  41.53 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  34.36 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 		 583 aa  88.6  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  33.95 
 
 		 173 aa  88.6  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  29.5 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  29.5 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  31.16 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  29.5 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  29.5 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  29.5 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  30.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  30.32 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  29.79 
 
 		 238 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  28.57 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  28.57 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  27.55 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  27.62 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  30.83 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  28.29 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  26.53 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  30.63 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  27.75 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  28.44 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 307 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  30.63 
 
 		 335 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 337 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  27.45 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 337 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 337 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 312 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  30.46 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 329 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  28.35 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 312 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  29.75 
 
 		 329 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  28.33 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  37.21 
 
 		 316 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 316 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  24.32 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 316 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  31.4 
 
 		 330 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  25.22 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  29.07 
 
 		 314 aa  47.8  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2622  pantothenate kinase  30.23 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.345143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3622  pantothenate kinase  30.69 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>