118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4137 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  88.04 
 
 
210 aa  344  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  59.9 
 
 
211 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  60.89 
 
 
213 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  57.5 
 
 
213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  58.91 
 
 
211 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  63.49 
 
 
221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  55.78 
 
 
207 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  55.96 
 
 
213 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  61.34 
 
 
226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  53.73 
 
 
217 aa  197  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  50 
 
 
219 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  59.12 
 
 
208 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  57.29 
 
 
229 aa  189  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  54.59 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  54.98 
 
 
215 aa  187  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.72 
 
 
208 aa  187  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  53.47 
 
 
205 aa  185  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  51.09 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  49.02 
 
 
216 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  50.25 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.72 
 
 
193 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.29 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.29 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  48.06 
 
 
228 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.66 
 
 
199 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  47.21 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.47 
 
 
226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  46.63 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  46.77 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  46.35 
 
 
212 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  42.55 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  42.41 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  42.93 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  37.31 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  38.05 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  38.05 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  41.57 
 
 
237 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.4 
 
 
226 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  40.1 
 
 
198 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  33.65 
 
 
210 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  36.95 
 
 
206 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  33.16 
 
 
240 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  29.44 
 
 
229 aa  104  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  34.62 
 
 
211 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  37.43 
 
 
261 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  34.15 
 
 
210 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.88 
 
 
234 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  31.07 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  38.95 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  34.42 
 
 
240 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 
583 aa  85.9  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  31.07 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  31.07 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  31.07 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  31.07 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  31.07 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  29.45 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  30.92 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  30.77 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  30.43 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  29.15 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  30.43 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  30.43 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  30.43 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.89 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  32.89 
 
 
330 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  29.23 
 
 
343 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  35 
 
 
335 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  31.75 
 
 
337 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  34.17 
 
 
336 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  32.5 
 
 
337 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  30.4 
 
 
324 aa  48.5  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  31.93 
 
 
307 aa  48.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  31.36 
 
 
316 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  33 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.86 
 
 
219 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  32.14 
 
 
319 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  31.67 
 
 
337 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  33.33 
 
 
329 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  28.57 
 
 
312 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  28.42 
 
 
315 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  25.68 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  29.2 
 
 
316 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  27.68 
 
 
312 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  31.36 
 
 
328 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  28.07 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  28.07 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  29.36 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  37.21 
 
 
320 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  22.28 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  28.33 
 
 
358 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  37.5 
 
 
345 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  22.9 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  32.18 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  25.81 
 
 
330 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  33.33 
 
 
318 aa  42.4  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1674  pantothenate kinase  29.41 
 
 
283 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0576097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0185  pantothenate kinase  28.32 
 
 
316 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128466  hitchhiker  0.000667129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>