114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3755 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  88.04 
 
 		 215 aa  331  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  57.21 
 
 		 211 aa  224  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  61.62 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  62.56 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  58.42 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  58.16 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  56.22 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  56.06 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  60.31 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  54.4 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  58.56 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  53 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  55.67 
 
 		 229 aa  188  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  50 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  56.12 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  55.94 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  49.49 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  55.05 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  48.51 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  50.99 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.78 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.78 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.63 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.27 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.02 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  47.87 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  46.34 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  46.94 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  47.67 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  48.44 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  38.12 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  39.11 
 
 		 232 aa  121  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  39.11 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  41.8 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  41.12 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  33.82 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  40.61 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  38.5 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  41.84 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  40.1 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  37.44 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  32.83 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  32.64 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  29.17 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  34.74 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  32.84 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.1 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  36.56 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.88 
 
 		 583 aa  90.9  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  34.38 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  31.82 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  29.69 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  29.69 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  29.69 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  29.69 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  29.69 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  28.1 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  30.29 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  30.29 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  29.32 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  28.8 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  27.75 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  28.8 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.69 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  30.48 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  32.03 
 
 		 307 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  31.67 
 
 		 371 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  22.83 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  34.17 
 
 		 335 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  31.75 
 
 		 337 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  28.72 
 
 		 320 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  29.6 
 
 		 324 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 319 aa  48.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  30.95 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  31.75 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  30.83 
 
 		 337 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  25 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 318 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 318 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  27.22 
 
 		 343 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  28.47 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  28.42 
 
 		 315 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  27.68 
 
 		 312 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3774  pantothenate kinase  25.79 
 
 		 316 aa  45.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  29.66 
 
 		 316 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  27.4 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0215  pantothenate kinase  25.67 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  26.79 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  24.49 
 
 		 288 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  32.18 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  28.37 
 
 		 358 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  36.11 
 
 		 345 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  27.94 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  30.51 
 
 		 328 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0181  pantothenate kinase  27.46 
 
 		 316 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000275629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>