71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0494 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  100 
 
 
371 aa  759    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  46.55 
 
 
288 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  40.96 
 
 
300 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  41.39 
 
 
290 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  39.34 
 
 
326 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  39.05 
 
 
296 aa  212  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  43.27 
 
 
291 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  41.04 
 
 
288 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  46.46 
 
 
255 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  37.59 
 
 
293 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  41 
 
 
269 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  33.52 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  30.42 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  30.14 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  30.28 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  30.31 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  32.72 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  28.37 
 
 
350 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  28.87 
 
 
356 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  34.51 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  29.62 
 
 
314 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 
312 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  28.14 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  28.98 
 
 
325 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  27.82 
 
 
315 aa  86.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  30.23 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  25.18 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  26.58 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  24.92 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  26.72 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  26.55 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  26.26 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  28.7 
 
 
215 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  33.1 
 
 
211 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0359  pantothenate kinase  27.22 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  23.14 
 
 
1320 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  28.49 
 
 
210 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  29.41 
 
 
226 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  24.29 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  25.29 
 
 
306 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  26.88 
 
 
210 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  34.09 
 
 
206 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  31 
 
 
219 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  25.84 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  27.07 
 
 
229 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  33.66 
 
 
228 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  27.49 
 
 
328 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  25.23 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  24.73 
 
 
229 aa  46.6  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  30 
 
 
212 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  23.42 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  26.63 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  33 
 
 
193 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  26.72 
 
 
213 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  33.33 
 
 
221 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  31.06 
 
 
224 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  31.67 
 
 
210 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  26.63 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  26.9 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  26.9 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  24.32 
 
 
335 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  27.38 
 
 
313 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  34.74 
 
 
211 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0189  pantothenate kinase  25 
 
 
323 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00328017  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  34.65 
 
 
216 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  30.69 
 
 
217 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  31.63 
 
 
208 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  28.23 
 
 
312 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  33 
 
 
208 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>