164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6929 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  58.13 
 
 		 211 aa  221  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  58.42 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  56 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  60.94 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  58.91 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.95 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  54.5 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  54.5 
 
 		 205 aa  187  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  51.28 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  53.77 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.41 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  50.5 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  53.44 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  48.47 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.31 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  52.82 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  45.13 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  47.32 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  48.54 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  45.85 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  46.57 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  52.22 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.46 
 
 		 193 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.73 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.73 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  49.72 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  43.65 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.23 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  51.79 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  44.62 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  37.44 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  35.68 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  42 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  32.23 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  41.5 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  44.28 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  43.37 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.07 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  37.44 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  36.41 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  36.41 
 
 		 232 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.05 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  37.31 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  34.83 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  34.15 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  38.17 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  35.61 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  37.74 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  32.84 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  28.34 
 
 		 583 aa  92.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  33.81 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  33.33 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  32.55 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  32.31 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  32.31 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  32.31 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  32.31 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  32.31 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  31.16 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  31.58 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  31.75 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  30 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  33.1 
 
 		 371 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  30 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  22.95 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  40.23 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  38.27 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  37.04 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  34.02 
 
 		 331 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  39.51 
 
 		 316 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  30 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  34.82 
 
 		 335 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  35.78 
 
 		 331 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  37.04 
 
 		 287 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  34.82 
 
 		 336 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  33.04 
 
 		 337 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  37.93 
 
 		 343 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  35.78 
 
 		 331 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  38.16 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3622  pantothenate kinase  33.66 
 
 		 322 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  35.63 
 
 		 316 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  38.16 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  34.75 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  28.34 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  34.65 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  37.04 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  36.46 
 
 		 328 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  42.11 
 
 		 328 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  26.79 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  31.67 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  34.57 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  37.93 
 
 		 345 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  25.36 
 
 		 288 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  36.78 
 
 		 312 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  39.02 
 
 		 324 aa  48.9  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>