137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0988 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 
207 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  61 
 
 
213 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.07 
 
 
208 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  58.33 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  55.72 
 
 
217 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  56.78 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  53.03 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  54.5 
 
 
211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  57.79 
 
 
229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  56.22 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  54.64 
 
 
219 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  55.12 
 
 
210 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.97 
 
 
199 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  57.51 
 
 
226 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  54.95 
 
 
211 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  58.89 
 
 
208 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  57.53 
 
 
215 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  54.87 
 
 
213 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  56.28 
 
 
193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  52.22 
 
 
205 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  47.85 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  47.14 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  47.14 
 
 
224 aa  157  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  45.5 
 
 
216 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  45.92 
 
 
216 aa  154  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.35 
 
 
226 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.35 
 
 
226 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  47.03 
 
 
204 aa  138  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  42.86 
 
 
232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.56 
 
 
226 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  42.86 
 
 
232 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  42.93 
 
 
237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  40.86 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  39.8 
 
 
213 aa  128  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  42 
 
 
217 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  38.83 
 
 
211 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  40.93 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  39.25 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  38.68 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  40.2 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  40.76 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  43.98 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  41.99 
 
 
198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.88 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  31.82 
 
 
240 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  40.2 
 
 
207 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  33.16 
 
 
212 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.25 
 
 
234 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  32.32 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  32.32 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  32.32 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  32.32 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  32.32 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  26.07 
 
 
229 aa  95.5  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  32.83 
 
 
244 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  34.59 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  31.91 
 
 
240 aa  89  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  34.05 
 
 
237 aa  89  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  33.52 
 
 
173 aa  88.6  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  34.05 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  34.05 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.02 
 
 
583 aa  78.6  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.48 
 
 
299 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  25.5 
 
 
219 aa  52.4  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  25.33 
 
 
316 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  25.33 
 
 
316 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  25.33 
 
 
316 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  26.58 
 
 
306 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  22.32 
 
 
316 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  27.98 
 
 
326 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  23.61 
 
 
316 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  21.74 
 
 
204 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  24.55 
 
 
316 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  24.55 
 
 
316 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4382  pantothenate kinase  24.55 
 
 
316 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000669891  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  27.44 
 
 
307 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  30.33 
 
 
220 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  25.96 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  25.45 
 
 
307 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  24.11 
 
 
316 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  24.11 
 
 
316 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  22.28 
 
 
504 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  25.58 
 
 
331 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  27.32 
 
 
312 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4016  pantothenate kinase  23.66 
 
 
308 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000159938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4046  pantothenate kinase  23.66 
 
 
308 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221747  hitchhiker  0.00101624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5439  pantothenate kinase  23.66 
 
 
308 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000280895  hitchhiker  0.000759717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03855  pantothenate kinase  23.66 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03808  hypothetical protein  23.66 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000563828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0606  pantothenate kinase  27.75 
 
 
313 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.380558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  26.22 
 
 
312 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4208  pantothenate kinase  23.66 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.8712499999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4513  pantothenate kinase  23.66 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000343104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4422  pantothenate kinase  23.66 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298887  hitchhiker  0.0000844896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4462  pantothenate kinase  23.66 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  28.37 
 
 
319 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>