86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3768 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  73.33 
 
 
208 aa  284  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.97 
 
 
207 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  51.6 
 
 
213 aa  185  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  48.76 
 
 
217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  52.63 
 
 
213 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  51.31 
 
 
211 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  50 
 
 
219 aa  175  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  49.74 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  50.51 
 
 
205 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  50.52 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  50.51 
 
 
213 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  50.79 
 
 
224 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  52.69 
 
 
211 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  51.31 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  49.74 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  47.85 
 
 
212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  50.27 
 
 
210 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  52.54 
 
 
208 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.1 
 
 
193 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  48.92 
 
 
215 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  50.52 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  42.56 
 
 
215 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.21 
 
 
226 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.21 
 
 
226 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  45.74 
 
 
228 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  44.68 
 
 
216 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.4 
 
 
226 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  41.49 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  40.76 
 
 
237 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  37.04 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  38.42 
 
 
217 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.07 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  42.33 
 
 
207 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  35.68 
 
 
213 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  40.32 
 
 
204 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  36.22 
 
 
198 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  37.43 
 
 
198 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  35.2 
 
 
198 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  33.83 
 
 
232 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  33.83 
 
 
232 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  34.48 
 
 
261 aa  101  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  35.94 
 
 
206 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  32.83 
 
 
240 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  35.26 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  32.14 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  33.83 
 
 
234 aa  95.5  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  32.99 
 
 
244 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  34.24 
 
 
237 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  34.24 
 
 
237 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  34.24 
 
 
237 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  34.24 
 
 
237 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  34.92 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  34.24 
 
 
237 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  35.03 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  34.46 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 
583 aa  87  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  26.7 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  35.03 
 
 
237 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  33.9 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  32.45 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  32.45 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  31.52 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  29.26 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  28.34 
 
 
219 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  25.81 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1674  pantothenate kinase  30.17 
 
 
283 aa  48.5  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0576097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.9 
 
 
343 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.57 
 
 
299 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.1 
 
 
340 aa  45.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  28.48 
 
 
330 aa  44.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  24.48 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  24.48 
 
 
232 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.24 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  35.23 
 
 
331 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  30.13 
 
 
307 aa  42.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  25.13 
 
 
209 aa  42.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  47.37 
 
 
333 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  24.48 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  37.5 
 
 
320 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.74 
 
 
323 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  31.25 
 
 
318 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  35.23 
 
 
331 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  32.09 
 
 
288 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>