175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3069 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 237 aa  493  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  96.2 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  95.78 
 
 		 237 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  94.51 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  84.81 
 
 		 237 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  84.81 
 
 		 237 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  84.81 
 
 		 237 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  84.81 
 
 		 237 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  84.81 
 
 		 237 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  72.88 
 
 		 238 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  72.03 
 
 		 238 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  44.26 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  38.38 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  34.21 
 
 		 213 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  35.38 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  35.45 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  37.89 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  37.89 
 
 		 198 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  35.23 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  36.51 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  39.15 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  34.76 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  39.38 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  38.42 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  31.2 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  32.81 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  35.16 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  32.29 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  36.36 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  34.25 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  33.15 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  32.63 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.07 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.05 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  32.43 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.78 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  32.99 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  36.65 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  37.22 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  32.28 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.88 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  32.24 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  22.64 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.76 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  33.99 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.76 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  34.86 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.9 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  29.23 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  31.52 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 		 583 aa  72.8  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  33.16 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.33 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  29.84 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  31.16 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  32.37 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  29.41 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  26.29 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  26.87 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3739  pantothenate kinase  24.88 
 
 		 316 aa  62  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  28.05 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  30.21 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  32.76 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  26.7 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2875  pantothenate kinase  22.65 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  27.01 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  27.01 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  29.65 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  24.75 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0196  pantothenate kinase  25.76 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03855  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4016  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000159938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5439  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000280895  hitchhiker  0.000759717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03808  hypothetical protein  25.35 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000563828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0202  pantothenate kinase  24.75 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4208  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.8712499999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4513  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000343104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4046  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221747  hitchhiker  0.00101624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4422  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298887  hitchhiker  0.0000844896 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  26.98 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  27.47 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4462  pantothenate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0189  pantothenate kinase  24.41 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00328017  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  22.86 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  27.1 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  24.88 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  28.32 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  28.11 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  23.46 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  24.88 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  24.88 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  24.88 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  24 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  23.94 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>