172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1817 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  423  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.03 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.03 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  51.85 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.68 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  51.32 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  48.26 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  45.86 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  46.86 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  47.98 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  47.87 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  46.15 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  46.81 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  43.09 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.5 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.24 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  47.87 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  45.13 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  48.89 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  46.81 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  44.15 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  43.39 
 
 		 211 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  46.52 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  43.52 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  44.72 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.56 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  38.19 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  43.65 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  42.78 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  38.69 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  38.69 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  45.5 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  40.1 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  44.44 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  40.41 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  41.67 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  40.93 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  33.17 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  40.64 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  33.99 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  33.99 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  33.99 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  33.99 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  33.99 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  40.72 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  31.98 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  33.19 
 
 		 583 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  31.53 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  35.08 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  35.83 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  36.51 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  30.69 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  34.22 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  34.76 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  34.04 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  33.51 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  32.8 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  33.33 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  32.49 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  29.76 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  30.39 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  29.9 
 
 		 238 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  32.07 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  28.79 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  28.22 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  29.94 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  31.75 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  32.43 
 
 		 329 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  28.87 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  25 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  30.89 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  32.6 
 
 		 320 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  25.86 
 
 		 331 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  30 
 
 		 330 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  26.54 
 
 		 322 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  30.07 
 
 		 287 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 337 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.78 
 
 		 325 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  27.33 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  27.57 
 
 		 316 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  27.33 
 
 		 317 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 313 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  26.97 
 
 		 331 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  31.94 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  25.81 
 
 		 316 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  27.54 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  26.71 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  27.03 
 
 		 330 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  25.33 
 
 		 306 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  27.83 
 
 		 309 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 336 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  27.1 
 
 		 375 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  25.93 
 
 		 322 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  26.97 
 
 		 331 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  24.44 
 
 		 329 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  23.96 
 
 		 318 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>