151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1238 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  64.73 
 
 		 217 aa  252  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  61.05 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  60.85 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  60.62 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  64.55 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  60.64 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  59.26 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  55.12 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  58.82 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  58.42 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  53.96 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  53.57 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  57.07 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  53.72 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  54.59 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  56.12 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.22 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.22 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.45 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.78 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.45 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  46.56 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  48.91 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  49.49 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  44.33 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  46.67 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  46.52 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.45 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  45.74 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  43.35 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  45.45 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  39.09 
 
 		 213 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  40.82 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  43.59 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  40.11 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  38.69 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  38.69 
 
 		 232 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  39.58 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  44.15 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  40.74 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  39.46 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  41.67 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  33.85 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  39.89 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.18 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  34.12 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  34.27 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  33.51 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  36.27 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  35.15 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  35.15 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  35.15 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  35.15 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  35.15 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  37.31 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  27.27 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  36.27 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  36.11 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 583 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  31.21 
 
 		 173 aa  86.3  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  34.57 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  30.46 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  33.85 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  30.84 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.45 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  28.97 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 312 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  27.84 
 
 		 313 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  23.91 
 
 		 312 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  28.75 
 
 		 318 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  29.55 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  29.09 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  28.98 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  30.54 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  28.48 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 330 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  27.54 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  31.07 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  29.7 
 
 		 329 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  28.87 
 
 		 333 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  26.42 
 
 		 318 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  22.16 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  27.67 
 
 		 331 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  25.32 
 
 		 306 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  26.42 
 
 		 318 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  27.51 
 
 		 331 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  36.26 
 
 		 325 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  24.32 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  27.04 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2526  pantothenate kinase  25.67 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  27.5 
 
 		 317 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  27.03 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  25.68 
 
 		 343 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  25.14 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  25.79 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  25.49 
 
 		 312 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>