210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0198 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  100 
 
 		 315 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0184  pantothenate kinase  75.72 
 
 		 316 aa  501  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000868575  normal  0.167512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0185  pantothenate kinase  75.4 
 
 		 316 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128466  hitchhiker  0.000667129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0215  pantothenate kinase  75.72 
 
 		 316 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0183  pantothenate kinase  75.4 
 
 		 316 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000066395  normal  0.0569679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0178  pantothenate kinase  75.08 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0139857  normal  0.0123189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4173  pantothenate kinase  75.72 
 
 		 316 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000219645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3774  pantothenate kinase  75.32 
 
 		 316 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0181  pantothenate kinase  75.72 
 
 		 316 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000275629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4071  pantothenate kinase  75.72 
 
 		 316 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.031551  normal  0.150968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  74.68 
 
 		 314 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  75 
 
 		 316 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4705  pantothenate kinase  73.4 
 
 		 316 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000664944  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  73.8 
 
 		 316 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  73.4 
 
 		 316 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0133  pantothenate kinase  73.08 
 
 		 316 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000279273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  61.64 
 
 		 307 aa  387  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  60 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  60.58 
 
 		 316 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  60.45 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  60.45 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  60.45 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  60.33 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0202  pantothenate kinase  59.34 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3622  pantothenate kinase  59.34 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0196  pantothenate kinase  59.34 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03855  pantothenate kinase  59.55 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4016  pantothenate kinase  60.33 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000159938  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  58.28 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3739  pantothenate kinase  60.33 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  58.28 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4382  pantothenate kinase  58.28 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000669891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4422  pantothenate kinase  59.55 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298887  hitchhiker  0.0000844896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4462  pantothenate kinase  59.24 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4046  pantothenate kinase  60.33 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221747  hitchhiker  0.00101624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5439  pantothenate kinase  60.33 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000280895  hitchhiker  0.000759717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0189  pantothenate kinase  59.34 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00328017  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  58.28 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4208  pantothenate kinase  59.55 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.8712499999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  58.28 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4513  pantothenate kinase  59.55 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000343104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03808  hypothetical protein  59.55 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000563828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  59.43 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0196  pantothenate kinase  59.67 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000216211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  61.11 
 
 		 287 aa  360  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  58.28 
 
 		 326 aa  352  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  56.68 
 
 		 307 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  57.65 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  56.37 
 
 		 312 aa  345  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  56.37 
 
 		 312 aa  345  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  56.37 
 
 		 312 aa  345  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  56.37 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  53.02 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  56.63 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  56.31 
 
 		 313 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  52.68 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  54.9 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  53.18 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  54.78 
 
 		 312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  56.21 
 
 		 329 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2875  pantothenate kinase  56.39 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  55.63 
 
 		 320 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  54.9 
 
 		 318 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  54.58 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  54.58 
 
 		 318 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  53.11 
 
 		 328 aa  332  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  53.48 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  53.59 
 
 		 317 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  53.27 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  53.99 
 
 		 318 aa  328  9e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  54.58 
 
 		 337 aa  328  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  51.74 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  54.43 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  54.58 
 
 		 336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  54.58 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  53.92 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  53.77 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  52.46 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  50.49 
 
 		 318 aa  325  5e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  52.4 
 
 		 318 aa  325  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  53.77 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  53.23 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  50.16 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  52.09 
 
 		 323 aa  322  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  53.27 
 
 		 337 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  53.92 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1137  pantothenate kinase  51.48 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.622081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  53.92 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  52.41 
 
 		 329 aa  318  7.999999999999999e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  50.99 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  53.42 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2622  pantothenate kinase  50.49 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.345143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2526  pantothenate kinase  53.42 
 
 		 318 aa  315  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  53.42 
 
 		 331 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  52.46 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0606  pantothenate kinase  54.49 
 
 		 313 aa  311  9e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.380558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  52.12 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  50.63 
 
 		 330 aa  308  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  52.46 
 
 		 330 aa  308  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  52.77 
 
 		 322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>