215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0129 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  85.71 
 
 
210 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  60.39 
 
 
211 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  59.7 
 
 
206 aa  248  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  45.5 
 
 
213 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  51.09 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  44.9 
 
 
232 aa  174  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  44.39 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  44.62 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  47.72 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  46 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  46 
 
 
198 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  46.88 
 
 
217 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  43.94 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  38.78 
 
 
221 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  35.75 
 
 
213 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.25 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.54 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  38.5 
 
 
211 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  40.66 
 
 
217 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  38.64 
 
 
219 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  37.36 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  38.54 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  39.15 
 
 
229 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  39.46 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.8 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  36.41 
 
 
213 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  38.8 
 
 
208 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  35.35 
 
 
237 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  35.35 
 
 
237 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  35.35 
 
 
237 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  35.35 
 
 
237 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  35.35 
 
 
237 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  38.17 
 
 
216 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  37.22 
 
 
212 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  36.26 
 
 
216 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  36.98 
 
 
238 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  36.32 
 
 
224 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  36.41 
 
 
237 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  35.71 
 
 
237 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  35.38 
 
 
237 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.89 
 
 
226 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.89 
 
 
226 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  36.46 
 
 
238 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.16 
 
 
212 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  33.85 
 
 
237 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  31.5 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  36.79 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  36.9 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  33.66 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  35.94 
 
 
213 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  32.84 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.22 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  34.21 
 
 
210 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  33.8 
 
 
244 aa  92  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  32.8 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  30.46 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.92 
 
 
199 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  36.07 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  34.31 
 
 
261 aa  85.1  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  26 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  29.38 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  29.44 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 
583 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  31.25 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  35.21 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  29.75 
 
 
173 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  35.46 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  32.21 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  31.13 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  28.99 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  29.56 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  42.53 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  29.27 
 
 
313 aa  64.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  29.8 
 
 
312 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  33.95 
 
 
328 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  27.33 
 
 
318 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  28.82 
 
 
316 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  28.82 
 
 
316 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  30.63 
 
 
326 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  28.82 
 
 
316 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  27.33 
 
 
318 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  35.56 
 
 
375 aa  62.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  32.14 
 
 
316 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  32.41 
 
 
345 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  27.98 
 
 
287 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  31.06 
 
 
343 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  33.54 
 
 
307 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0851  pantothenate kinase  28.49 
 
 
306 aa  62  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00289921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  30.43 
 
 
316 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  29.14 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  28.49 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  28.57 
 
 
307 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  28.4 
 
 
316 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  28.4 
 
 
316 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  28.4 
 
 
316 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4382  pantothenate kinase  28.4 
 
 
316 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000669891  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  27.34 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  28.4 
 
 
316 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>