117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001416 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  44.67 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  44.26 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  44.26 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  43.44 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  42.62 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  42.21 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  43.39 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  43.39 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  43.39 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  43.39 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  43.39 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  35.41 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  34.43 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  33.5 
 
 		 198 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  33 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  33.82 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.33 
 
 		 208 aa  95.1  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  33.82 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  33.82 
 
 		 198 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.83 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  33.8 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  32.75 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  30.77 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  29.76 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  31.38 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.99 
 
 		 199 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  31.34 
 
 		 232 aa  85.5  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  31.03 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.64 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  30.85 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  30.58 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  32.84 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  31.91 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 		 583 aa  79  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  30.61 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  28.08 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  27.03 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  28.99 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  29.56 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  29.56 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  32.55 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.33 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.33 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  29.03 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  28.85 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  31.52 
 
 		 173 aa  72  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  27.05 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  25.96 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  29.27 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  28.37 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  30.46 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  30.81 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  24.49 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  30.05 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  30.65 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  27.62 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  30.63 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.94 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  23 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  24.75 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  27.62 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  30.11 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  25.68 
 
 		 307 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  24.42 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  25.14 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  27.1 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  24.56 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0189  pantothenate kinase  25.38 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00328017  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  25.14 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  27.21 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03855  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4016  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000159938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4208  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.8712499999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4513  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000343104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4046  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221747  hitchhiker  0.00101624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5439  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000280895  hitchhiker  0.000759717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03808  hypothetical protein  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000563828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  25.88 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4422  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298887  hitchhiker  0.0000844896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4462  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4382  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000669891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  24.46 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  25.38 
 
 		 316 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  27.95 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  23.98 
 
 		 316 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  23.98 
 
 		 316 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  23.98 
 
 		 316 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  26.37 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  26.37 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  26.5 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  25.13 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>