148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2255 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  63.21 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  50.74 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  48.36 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  49.02 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.74 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  49.74 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  45.59 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  45.25 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  46.67 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  49.74 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.97 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.92 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  45.69 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  44.1 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.83 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  45.85 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  44.5 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  49.75 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  43.98 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  49.47 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  41.9 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  47.64 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  44.06 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  46.56 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  43.69 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.6 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.27 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  43.09 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  44.28 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  43.94 
 
 		 204 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  38.46 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  38.46 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  42.86 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  37.95 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  42.56 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  40.1 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  39.78 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  39.9 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  39.55 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  40.46 
 
 		 198 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  37.22 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  36.46 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  33.16 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.37 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.73 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  28.64 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  35.18 
 
 		 261 aa  95.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  37.43 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  37.43 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  37.43 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  37.43 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  37.43 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  37.7 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  37.16 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  30.73 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  37.16 
 
 		 237 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  36.07 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  33.88 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  33.68 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  33.51 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 		 583 aa  78.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  31.25 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  25.96 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  30.48 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  28.66 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  31.29 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  27.92 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2622  pantothenate kinase  27.64 
 
 		 331 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.345143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  27.92 
 
 		 312 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  29.61 
 
 		 315 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  25.27 
 
 		 316 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  29.84 
 
 		 337 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  32.07 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  31.25 
 
 		 329 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  28.16 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  29.53 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  32 
 
 		 337 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  26.29 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  29.33 
 
 		 335 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  29.32 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 317 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  27.14 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 314 aa  50.1  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  29.33 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  22.63 
 
 		 306 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  31.73 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  31.73 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  31.73 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  30.58 
 
 		 318 aa  48.5  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  30.58 
 
 		 318 aa  48.5  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2526  pantothenate kinase  27.62 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  31.3 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  27.33 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  29.63 
 
 		 331 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>