256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3611 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 208 aa  407  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  61.46 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  59.51 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.35 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  56.44 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  57.71 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  59.34 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  53.08 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  57.79 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  51.52 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  57.22 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  59.14 
 
 		 215 aa  187  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  50 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  54.63 
 
 		 229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.7 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  56.38 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  50.99 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.67 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  53.23 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  49.51 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  54.01 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  49 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  49 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  54.05 
 
 		 224 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  50.97 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.49 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  48.44 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  53.97 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  50 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  49.67 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  49.67 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  44.72 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  48.77 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  40 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  39.51 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  39.51 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  34.43 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  42.16 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  43.58 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  42.36 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  36.08 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  39.57 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  39.91 
 
 		 261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  40.8 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  45.99 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  38.1 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  33.68 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  35.32 
 
 		 238 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  35.32 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  31.46 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  35.83 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  33.15 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  35.83 
 
 		 237 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  35.83 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  35.83 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  35.83 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  35.83 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  35.83 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  35.29 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  35.29 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  33.54 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  35.45 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  30.23 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 		 583 aa  79  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.44 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  35.14 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  28 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  28 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  28 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  32.2 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  26.29 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  31.11 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  31.67 
 
 		 330 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  30.28 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  24.85 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  35.71 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  25.49 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  29.89 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  30.37 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  29.05 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  26.55 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0196  pantothenate kinase  27.43 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  27.43 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  34.23 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  28.42 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  30.34 
 
 		 358 aa  55.1  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  33.91 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0606  pantothenate kinase  27.83 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.380558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 328 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  28.33 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  32.43 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  28.96 
 
 		 331 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  32.43 
 
 		 337 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  31.53 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0851  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 306 aa  52.8  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00289921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>