195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3839 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 193 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  57.78 
 
 		 213 aa  189  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  56.28 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  54.75 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  54.95 
 
 		 213 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  58.06 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  56.68 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  54.74 
 
 		 228 aa  178  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  55.44 
 
 		 229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  52.69 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  52.91 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  52.15 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  47.28 
 
 		 219 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  50.83 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.27 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  52.43 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  50 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  52.46 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  45.6 
 
 		 212 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  52.72 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  52.97 
 
 		 226 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  52.78 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.55 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  51.63 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  46.24 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.81 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.81 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  46.6 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.65 
 
 		 226 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  42.16 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  39.78 
 
 		 232 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  39.78 
 
 		 232 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  47.83 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  41.94 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  39.13 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  43.75 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  40.54 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  45.08 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  42.86 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  40.23 
 
 		 237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  44.38 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  44.38 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  43.79 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  36.99 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  36.45 
 
 		 261 aa  97.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  37.63 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  37.63 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  32.46 
 
 		 226 aa  95.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  40.11 
 
 		 212 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  34.43 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  34.43 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  34.43 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  34.43 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  34.43 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  37.06 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  30.73 
 
 		 229 aa  87  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  34.15 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  36.47 
 
 		 237 aa  84.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  32.64 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  35.88 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  29.23 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  35.88 
 
 		 237 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  30.65 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  32.8 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 583 aa  74.7  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  32.9 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  39.08 
 
 		 343 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  28.31 
 
 		 306 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  35.34 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  38.3 
 
 		 330 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  37.21 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  30.52 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  37.76 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0133  pantothenate kinase  34.78 
 
 		 316 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000279273  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  34.09 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  36.36 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  36.21 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  39.8 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  35.23 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  32.5 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  36.78 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  26.98 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  35.63 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2622  pantothenate kinase  37.21 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.345143 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  26.98 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  39.08 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  36.36 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  32.63 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  36.05 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 375 aa  58.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  36.05 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 331 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0184  pantothenate kinase  35.42 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000868575  normal  0.167512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  30.17 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  31.03 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0178  pantothenate kinase  35.42 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0139857  normal  0.0123189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  35.42 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>