169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0781 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  64.49 
 
 
217 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  62.8 
 
 
210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  58.16 
 
 
219 aa  207  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  57.92 
 
 
213 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  57.21 
 
 
213 aa  202  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  58.08 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  57.07 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  54.9 
 
 
210 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  55 
 
 
226 aa  190  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  56.25 
 
 
215 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  52.48 
 
 
212 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.41 
 
 
207 aa  188  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  51.46 
 
 
211 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  57.14 
 
 
229 aa  184  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  55.38 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  52.22 
 
 
211 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  49.27 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.91 
 
 
193 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  50.75 
 
 
205 aa  165  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.94 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  48.21 
 
 
215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.19 
 
 
226 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.19 
 
 
226 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.51 
 
 
199 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  47.09 
 
 
226 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  45.69 
 
 
216 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  45.67 
 
 
224 aa  148  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  47.26 
 
 
228 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  47.5 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  39.71 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  39.71 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  38.21 
 
 
232 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  38.21 
 
 
232 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  37.62 
 
 
213 aa  121  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  34.91 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  39.23 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  42.86 
 
 
206 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  39.52 
 
 
237 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  41.71 
 
 
204 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  38.78 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  38.54 
 
 
210 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  37.76 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  30.56 
 
 
234 aa  98.6  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  31.9 
 
 
240 aa  98.2  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  42.21 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  36 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  30.56 
 
 
229 aa  92  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  34.74 
 
 
261 aa  91.3  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  33.33 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  30.73 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  30.73 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  30.73 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  29.83 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  30.73 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  30.73 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 
583 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  32.12 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  32.29 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  32.12 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  31.61 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  31.25 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  31.25 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  30.81 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  29.27 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  29.36 
 
 
322 aa  62.4  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  29.36 
 
 
322 aa  62.4  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.08 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  29.36 
 
 
331 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  27.85 
 
 
330 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  29.36 
 
 
331 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  32.28 
 
 
337 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  31.05 
 
 
337 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  27.98 
 
 
331 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  31.75 
 
 
337 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  27.85 
 
 
330 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  30.14 
 
 
329 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  27.52 
 
 
322 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  30.28 
 
 
328 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  31.05 
 
 
336 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  27.65 
 
 
316 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  26.51 
 
 
306 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  27.95 
 
 
316 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  30.59 
 
 
335 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  29.28 
 
 
319 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  29.63 
 
 
345 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  27.39 
 
 
343 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  27.19 
 
 
316 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  28.07 
 
 
315 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4705  pantothenate kinase  30.82 
 
 
316 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000664944  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  27.44 
 
 
305 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  26.99 
 
 
375 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  28.17 
 
 
313 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  27.52 
 
 
309 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  31.02 
 
 
312 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  26.13 
 
 
330 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  27.52 
 
 
326 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  27.52 
 
 
323 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  31.61 
 
 
316 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>