267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0128 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  85.71 
 
 
210 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  61.35 
 
 
211 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  60.59 
 
 
206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  50.54 
 
 
207 aa  177  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  41.95 
 
 
213 aa  174  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  41.79 
 
 
232 aa  168  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  41.29 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  47 
 
 
198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  45.81 
 
 
198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  45.81 
 
 
198 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  43.59 
 
 
237 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  46.35 
 
 
217 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  148  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.86 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  38.27 
 
 
221 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  38.5 
 
 
213 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.16 
 
 
193 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  40.34 
 
 
219 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  41.15 
 
 
217 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  40 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  39.66 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  38.83 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  39.89 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  39.78 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  40.11 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  40.11 
 
 
210 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  38.71 
 
 
213 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  39.33 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  39.52 
 
 
224 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.46 
 
 
208 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  34.38 
 
 
237 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  34.38 
 
 
237 aa  104  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  34.38 
 
 
237 aa  104  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  34.38 
 
 
237 aa  104  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  34.38 
 
 
237 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  35.82 
 
 
216 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  38.97 
 
 
228 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  34.5 
 
 
240 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  36.14 
 
 
238 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  38.54 
 
 
213 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  36.51 
 
 
237 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  35.45 
 
 
237 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  33.65 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  35.64 
 
 
238 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  35.45 
 
 
237 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  36.36 
 
 
226 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  34.92 
 
 
237 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.32 
 
 
226 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.32 
 
 
226 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  34.62 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  34.15 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  34.04 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  32.49 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.22 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.26 
 
 
199 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  33.33 
 
 
244 aa  88.2  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  29.5 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  33.67 
 
 
261 aa  86.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.44 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
583 aa  79.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  32.46 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  29.65 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  33.77 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  32.14 
 
 
312 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  30.82 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  44.83 
 
 
330 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  35.92 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  30.18 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  33.33 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  28.93 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  35.4 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  27.33 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  27.33 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  36.09 
 
 
328 aa  65.1  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  35.71 
 
 
336 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  30.43 
 
 
312 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  30.38 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  30.43 
 
 
312 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  30.43 
 
 
312 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  27.92 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  31.3 
 
 
287 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  33.11 
 
 
307 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  30.53 
 
 
307 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  35.71 
 
 
329 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  31.13 
 
 
312 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  29.17 
 
 
312 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  33.04 
 
 
316 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  31.62 
 
 
328 aa  62  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  33.04 
 
 
316 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  33.04 
 
 
316 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3622  pantothenate kinase  31.07 
 
 
322 aa  61.6  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0359  pantothenate kinase  24.85 
 
 
312 aa  61.6  0.000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  30.3 
 
 
330 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  35.71 
 
 
315 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  35.82 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  28.21 
 
 
316 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  37.96 
 
 
316 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.325871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>