115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2554 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  61 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  59 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  59.8 
 
 		 213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  64.55 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  60.94 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  61.62 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  57.84 
 
 		 229 aa  207  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  56.86 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  60.89 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  58.85 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  53.5 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  55.24 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  56.7 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  57.29 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  60.56 
 
 		 208 aa  191  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  54.5 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.47 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  50.26 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.95 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  50 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.61 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.61 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  46.86 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.11 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  49.74 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.61 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  49.01 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  47.29 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  48.91 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  40.3 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  40.2 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  39.32 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  41.21 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  41.21 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  46.67 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  38.5 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  35.75 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  40.62 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  40.59 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  37.25 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  40.54 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  40.54 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  33.01 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  39.17 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  34.62 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  31.82 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  37.97 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  29.23 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  29.74 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  31.48 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  32.8 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  32.8 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  32.8 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 583 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  28.37 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  31.98 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  32.56 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  32.37 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  32.56 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  31.22 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  30.12 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  33.04 
 
 		 335 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  33.04 
 
 		 336 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  22.95 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  29.22 
 
 		 319 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  33.61 
 
 		 329 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1674  pantothenate kinase  29.37 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0576097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  28.97 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  30.36 
 
 		 337 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  33.04 
 
 		 330 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  30.36 
 
 		 337 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  30.36 
 
 		 337 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  28.42 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  35.63 
 
 		 314 aa  47  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  29.37 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  36.67 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  28.5 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  28.7 
 
 		 330 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  28 
 
 		 318 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  28 
 
 		 318 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  27.94 
 
 		 312 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  25.89 
 
 		 318 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  25.89 
 
 		 318 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 358 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  25.47 
 
 		 312 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  25.71 
 
 		 288 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  30.33 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  32.35 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  29.57 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  28.8 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  26.43 
 
 		 306 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  23.19 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  28.41 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>