162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1674 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1674  pantothenate kinase  100 
 
 
283 aa  586  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0576097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  41.76 
 
 
329 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  40.89 
 
 
322 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  40.89 
 
 
322 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  38.7 
 
 
330 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  41 
 
 
335 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  39.23 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  40.23 
 
 
336 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  41.1 
 
 
307 aa  200  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  39.08 
 
 
331 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  38.15 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  38.46 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  39.62 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  38.08 
 
 
318 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  38.08 
 
 
318 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  40.76 
 
 
306 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  39.46 
 
 
337 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  39.46 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  41.38 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  37.69 
 
 
358 aa  195  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  39.08 
 
 
337 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  38.46 
 
 
317 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  40.16 
 
 
314 aa  193  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  39.08 
 
 
316 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  36.54 
 
 
330 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  35.63 
 
 
328 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  41.38 
 
 
331 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  38.89 
 
 
326 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  37.11 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  40.17 
 
 
330 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  36.72 
 
 
313 aa  188  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2526  pantothenate kinase  34.27 
 
 
318 aa  188  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  39.02 
 
 
318 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  38.7 
 
 
330 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  36.12 
 
 
307 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  41.38 
 
 
331 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  36.4 
 
 
318 aa  185  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  35.38 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0851  pantothenate kinase  35.42 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00289921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  37.31 
 
 
318 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  35.91 
 
 
312 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  36.92 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0202  pantothenate kinase  37.92 
 
 
316 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  38.78 
 
 
314 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0196  pantothenate kinase  37.5 
 
 
316 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  35.38 
 
 
305 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  36.98 
 
 
310 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  37.08 
 
 
316 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2622  pantothenate kinase  35.38 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.345143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0606  pantothenate kinase  37.55 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.380558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3739  pantothenate kinase  37.92 
 
 
316 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  35.91 
 
 
312 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  35.02 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  35.14 
 
 
312 aa  178  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  35.89 
 
 
345 aa  178  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  37.08 
 
 
316 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  37.08 
 
 
316 aa  178  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  37.08 
 
 
316 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  35.14 
 
 
312 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  36.73 
 
 
324 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  35.14 
 
 
312 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  35.14 
 
 
312 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  33.96 
 
 
336 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  35.2 
 
 
328 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  34.36 
 
 
316 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4422  pantothenate kinase  36.3 
 
 
316 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298887  hitchhiker  0.0000844896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  37.5 
 
 
316 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  37.5 
 
 
316 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  37.5 
 
 
316 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  37.5 
 
 
316 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4382  pantothenate kinase  37.5 
 
 
316 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000669891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03855  pantothenate kinase  35.93 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  37.08 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03808  hypothetical protein  35.93 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000563828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4208  pantothenate kinase  35.93 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.8712499999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4513  pantothenate kinase  35.93 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000343104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  38.24 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4462  pantothenate kinase  35.93 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4016  pantothenate kinase  35.93 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000159938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5439  pantothenate kinase  35.93 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000280895  hitchhiker  0.000759717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  35.89 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4046  pantothenate kinase  35.93 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221747  hitchhiker  0.00101624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1137  pantothenate kinase  35 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.622081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3622  pantothenate kinase  34.38 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  37.5 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  33.46 
 
 
315 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  34.24 
 
 
329 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0189  pantothenate kinase  36.67 
 
 
323 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00328017  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0196  pantothenate kinase  36.84 
 
 
317 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000216211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  38.39 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  32.31 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  36.25 
 
 
307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  32.42 
 
 
318 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0133  pantothenate kinase  36.13 
 
 
316 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000279273  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  35.83 
 
 
287 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  36.55 
 
 
315 aa  158  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  36.13 
 
 
314 aa  158  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  36.24 
 
 
375 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3774  pantothenate kinase  35.04 
 
 
316 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  35.66 
 
 
316 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>