194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0411 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  100 
 
 
318 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  98.43 
 
 
318 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  93.71 
 
 
318 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  85.85 
 
 
317 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  83.33 
 
 
318 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  83.02 
 
 
318 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  80.19 
 
 
318 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  67.31 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  67.63 
 
 
335 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  65.92 
 
 
323 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  62.38 
 
 
331 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  61.29 
 
 
331 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  62.38 
 
 
330 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  61.61 
 
 
331 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  61.17 
 
 
330 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  60.97 
 
 
322 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  63.11 
 
 
337 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  60.97 
 
 
322 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  60.32 
 
 
322 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  63.11 
 
 
337 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  61.36 
 
 
358 aa  388  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  62.78 
 
 
337 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  60.88 
 
 
326 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  61.81 
 
 
329 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  60 
 
 
319 aa  381  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  59.74 
 
 
330 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  58.06 
 
 
314 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0196  pantothenate kinase  56.68 
 
 
316 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  57.56 
 
 
320 aa  352  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  55.35 
 
 
318 aa  352  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  56.78 
 
 
336 aa  352  5e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  56.31 
 
 
316 aa  350  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0202  pantothenate kinase  55.7 
 
 
316 aa  349  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  53.94 
 
 
316 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  56.03 
 
 
316 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  56.03 
 
 
316 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4382  pantothenate kinase  56.03 
 
 
316 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000669891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  56.03 
 
 
316 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  56.03 
 
 
316 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  53.14 
 
 
318 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  56.17 
 
 
343 aa  346  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3739  pantothenate kinase  56.03 
 
 
316 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  55.41 
 
 
314 aa  346  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0189  pantothenate kinase  54.75 
 
 
323 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00328017  normal  0.453371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03855  pantothenate kinase  55.7 
 
 
316 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03808  hypothetical protein  55.7 
 
 
316 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000563828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  56.54 
 
 
328 aa  345  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4208  pantothenate kinase  55.7 
 
 
316 aa  345  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.8712499999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4513  pantothenate kinase  55.7 
 
 
316 aa  345  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000343104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4422  pantothenate kinase  55.7 
 
 
316 aa  345  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298887  hitchhiker  0.0000844896 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  52.83 
 
 
318 aa  345  6e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5439  pantothenate kinase  55.7 
 
 
308 aa  345  8e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000280895  hitchhiker  0.000759717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4016  pantothenate kinase  55.7 
 
 
308 aa  345  8e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000159938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4046  pantothenate kinase  55.7 
 
 
308 aa  345  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221747  hitchhiker  0.00101624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  55.19 
 
 
313 aa  343  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  55.05 
 
 
316 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  57.74 
 
 
307 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4462  pantothenate kinase  55.37 
 
 
316 aa  343  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  55.84 
 
 
315 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  56.49 
 
 
316 aa  343  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  54.63 
 
 
313 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  52.75 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  57.28 
 
 
329 aa  342  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  56.77 
 
 
310 aa  340  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4705  pantothenate kinase  53.72 
 
 
316 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000664944  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  56.65 
 
 
324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0196  pantothenate kinase  52.75 
 
 
317 aa  338  7e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000216211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4173  pantothenate kinase  54.58 
 
 
316 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000219645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0181  pantothenate kinase  54.58 
 
 
316 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000275629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4071  pantothenate kinase  54.58 
 
 
316 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.031551  normal  0.150968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  55.19 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0185  pantothenate kinase  54.58 
 
 
316 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128466  hitchhiker  0.000667129 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  52.77 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  54.69 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  55.45 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  55.45 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  55.45 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  54.4 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  53.75 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  53.75 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  53.75 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0133  pantothenate kinase  53.27 
 
 
316 aa  335  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000279273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  54.9 
 
 
315 aa  335  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3774  pantothenate kinase  54.58 
 
 
316 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2526  pantothenate kinase  56.17 
 
 
318 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  52.6 
 
 
375 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0215  pantothenate kinase  54.58 
 
 
316 aa  332  6e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0184  pantothenate kinase  54.58 
 
 
316 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000868575  normal  0.167512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  55.78 
 
 
305 aa  331  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  54.22 
 
 
345 aa  329  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  54.06 
 
 
330 aa  329  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0178  pantothenate kinase  53.92 
 
 
316 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0139857  normal  0.0123189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0183  pantothenate kinase  53.92 
 
 
316 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000066395  normal  0.0569679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  53.21 
 
 
312 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  52.56 
 
 
312 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2622  pantothenate kinase  53.25 
 
 
331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.345143 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  51.95 
 
 
307 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  54.02 
 
 
314 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1137  pantothenate kinase  53.9 
 
 
310 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.622081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  54.07 
 
 
314 aa  318  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>