68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0521 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  603  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  70.03 
 
 
293 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  50.87 
 
 
296 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  46.15 
 
 
300 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  46.26 
 
 
290 aa  257  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  40.14 
 
 
291 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  36.97 
 
 
288 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  41.04 
 
 
371 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  39.26 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  37.25 
 
 
255 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  33.81 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  32.16 
 
 
321 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  30.14 
 
 
350 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  28.2 
 
 
292 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  31.67 
 
 
348 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 
312 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  29.44 
 
 
334 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  31.95 
 
 
349 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  31.54 
 
 
349 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  30.16 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  30.95 
 
 
359 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  27.99 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  29.83 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  27.24 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  25.88 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  25.48 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  27.71 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  30.33 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  27.31 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  25.19 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  23.33 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  27.8 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  28.21 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  29.03 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  27.03 
 
 
1320 aa  58.9  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  28 
 
 
221 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  27.1 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  25.36 
 
 
211 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  27.78 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  27.97 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  31.25 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  23.58 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  28.87 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  28.87 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.36 
 
 
208 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  25.14 
 
 
213 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.34 
 
 
226 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  27.73 
 
 
210 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  27.61 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  24.8 
 
 
210 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.68 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.18 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  26.67 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.18 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  25.71 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  36.07 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  24.06 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  24.06 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  25.87 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  33.33 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  27.5 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  26.45 
 
 
212 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  28.03 
 
 
213 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  26.67 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  24.44 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  25.86 
 
 
583 aa  42.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  27.34 
 
 
358 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>