82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02158 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  100 
 
 		 290 aa  606  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  54.77 
 
 		 296 aa  326  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  42.76 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  46.26 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  44.06 
 
 		 300 aa  255  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  41.38 
 
 		 288 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  40.99 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  48.15 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  41.39 
 
 		 371 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  32.86 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  40.25 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  34.15 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  33.47 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  33.47 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  33.05 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  31.4 
 
 		 348 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  31.33 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  32.38 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  30.26 
 
 		 350 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  29 
 
 		 312 aa  98.6  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  29.08 
 
 		 292 aa  98.6  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  28.85 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  31.35 
 
 		 1320 aa  90.9  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  28.3 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  28.96 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  27.71 
 
 		 325 aa  86.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  27.54 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  26.97 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  28.24 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  26.39 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  25.42 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  26.22 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  26.32 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  30.94 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  29.75 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  29.77 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  27.97 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  27.97 
 
 		 238 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  25.95 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  25.95 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  25.47 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  24.81 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0851  pantothenate kinase  29.55 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00289921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  25.95 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  26.11 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  27.94 
 
 		 211 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  25.95 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  25.62 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  29.49 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  29.85 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  26.71 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  26.25 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  27.21 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  26.09 
 
 		 335 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0359  pantothenate kinase  22.47 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  26.57 
 
 		 318 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.71 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  22.79 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  27.78 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  26.71 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  28.3 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.25 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  24.84 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  24.63 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  24.68 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  26.22 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  26.28 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  26.03 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.3 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  23.7 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0196  pantothenate kinase  25.74 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  27.54 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  29.8 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  32.86 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  25.66 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  25.66 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2913  pantothenate kinase  26.4 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4705  pantothenate kinase  26.87 
 
 		 316 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000664944  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3739  pantothenate kinase  25.74 
 
 		 316 aa  42.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  26.56 
 
 		 218 aa  42.4  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>