55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1871 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  100 
 
 		 255 aa  494  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  57.26 
 
 		 291 aa  264  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  48.15 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  46.94 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  50.61 
 
 		 288 aa  228  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  45.08 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  46.85 
 
 		 371 aa  217  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  40.77 
 
 		 326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  49.16 
 
 		 269 aa  201  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  38.46 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  35.57 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  33.2 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  34.87 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  35.71 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  33.07 
 
 		 356 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  33.07 
 
 		 349 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  30.95 
 
 		 348 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  32.68 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  29.8 
 
 		 350 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  29.96 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  31.87 
 
 		 325 aa  98.6  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  34.67 
 
 		 328 aa  93.2  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  25.95 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  31.65 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  26.76 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  26.89 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  30.9 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  29.6 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  25.82 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  26.17 
 
 		 336 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  28.04 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  26.32 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  27.64 
 
 		 1320 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  33.9 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  39.34 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  37.5 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  29.13 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  29.25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  40.62 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  39.17 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  32.54 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  37.04 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  29.56 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  31.43 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  35 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.33 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  27.27 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  29.31 
 
 		 550 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  28.29 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  39.29 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  32.5 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  33.91 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  31.58 
 
 		 223 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>