67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3207 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  45.52 
 
 		 288 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  47.54 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  46.15 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  44.06 
 
 		 290 aa  255  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  42.56 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  45.68 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  40.96 
 
 		 371 aa  228  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  37.64 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  44.67 
 
 		 255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  43.95 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  29.32 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  28.68 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  28.31 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  29.08 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  28.19 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  30.04 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  28.24 
 
 		 348 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  30.24 
 
 		 359 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  27.51 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  29.96 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  31.36 
 
 		 328 aa  86.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  28.51 
 
 		 1320 aa  85.5  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  28.05 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  27.41 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  24.8 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  26.21 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  27.83 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  26.24 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  23.81 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  26.39 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  28.14 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1533  pantothenate kinase  29.63 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0359  pantothenate kinase  29.92 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  28.8 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  30.65 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  30.65 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  27.41 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  28.91 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  28.91 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  31.82 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  31.82 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  30.65 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  29.6 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  33 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  28.46 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  28.23 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0184  pantothenate kinase  27.71 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000868575  normal  0.167512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.78 
 
 		 208 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4173  pantothenate kinase  27.71 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000219645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3774  pantothenate kinase  27.11 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0181  pantothenate kinase  27.71 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000275629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4071  pantothenate kinase  27.71 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.031551  normal  0.150968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  28.91 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0185  pantothenate kinase  27.71 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128466  hitchhiker  0.000667129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  32 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 316 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  29.55 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  33.8 
 
 		 204 aa  42.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>