46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0509 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  613  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  70.03 
 
 
288 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  49.32 
 
 
296 aa  298  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  42.76 
 
 
290 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  42.56 
 
 
300 aa  248  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  36.9 
 
 
291 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  35.52 
 
 
288 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  37.59 
 
 
371 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  33.21 
 
 
326 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  35.77 
 
 
269 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  35.18 
 
 
255 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  32.64 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  30.59 
 
 
334 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  33.47 
 
 
349 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  30.04 
 
 
359 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  29 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  28.94 
 
 
350 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  26.82 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 
312 aa  92  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  33.06 
 
 
349 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  31.93 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  29.8 
 
 
356 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  23.77 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  25.48 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  26.03 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  23.36 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  26.19 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  27.21 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  27.56 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  30.82 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  25.28 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  27.23 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  23.77 
 
 
1320 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  27.74 
 
 
229 aa  53.5  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  26.23 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  25.56 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  23.53 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  25.44 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  23.53 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  24.37 
 
 
216 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  26.72 
 
 
229 aa  43.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  44.44 
 
 
198 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  44.44 
 
 
198 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.47 
 
 
325 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.41 
 
 
343 aa  42.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>