43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38956 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  100 
 
 
292 aa  599  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 
321 aa  158  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  34.88 
 
 
358 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  32.97 
 
 
1320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  31 
 
 
288 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  31.8 
 
 
359 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  29.5 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  32.2 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  32 
 
 
291 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  32.72 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  33.19 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  29.74 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  28.19 
 
 
300 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  31.3 
 
 
336 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  28.2 
 
 
288 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  27.21 
 
 
326 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  30.7 
 
 
349 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  32.89 
 
 
334 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  33.9 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  29.08 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  31.25 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  30.7 
 
 
349 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  26.82 
 
 
293 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  29.55 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  28.57 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  29.33 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  28.14 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  29.28 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  28.95 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  27.53 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  29.46 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  25.1 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  27.63 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  25.71 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  27.48 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  33.75 
 
 
203 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  25.19 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  36.54 
 
 
203 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3206  urease accessory protein UreG  38.6 
 
 
220 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00429017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  38.78 
 
 
203 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3054  uridine kinase  40.74 
 
 
201 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.654412  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0338  urease accessory protein UreG  43.75 
 
 
206 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>