More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3468 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3468  urease accessory protein UreG  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  87.19 
 
 		 203 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  87.19 
 
 		 203 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  82.76 
 
 		 203 aa  348  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_004310  BR0273  urease accessory protein UreG  77.34 
 
 		 208 aa  327  7e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0338  urease accessory protein UreG  76.85 
 
 		 206 aa  327  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0287  urease accessory protein UreG  76.85 
 
 		 208 aa  327  9e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2687  urease accessory protein UreG  72.91 
 
 		 207 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  68.47 
 
 		 206 aa  298  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  69.23 
 
 		 203 aa  287  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  69.23 
 
 		 203 aa  287  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  69.19 
 
 		 225 aa  285  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 205 aa  284  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  67.88 
 
 		 200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  69.15 
 
 		 202 aa  281  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  66.01 
 
 		 209 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  67 
 
 		 207 aa  280  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  68.16 
 
 		 204 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  65.52 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  66.01 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  65.22 
 
 		 211 aa  278  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  70.15 
 
 		 204 aa  278  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  68.37 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  65.02 
 
 		 207 aa  278  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  67.01 
 
 		 204 aa  277  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  67 
 
 		 207 aa  277  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  67.01 
 
 		 204 aa  277  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  65.02 
 
 		 204 aa  276  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  65.02 
 
 		 204 aa  276  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 204 aa  276  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  67.84 
 
 		 204 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  64.82 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  65.02 
 
 		 204 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  67.01 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  66.83 
 
 		 202 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  65.48 
 
 		 204 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 201 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  67.01 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  64.53 
 
 		 213 aa  272  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  64.82 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  67.01 
 
 		 215 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  65.17 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  66 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 215 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 215 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  65.02 
 
 		 203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  66 
 
 		 207 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  64.29 
 
 		 203 aa  267  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  66 
 
 		 207 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  65.48 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  65.13 
 
 		 217 aa  264  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  62.83 
 
 		 202 aa  264  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  64.97 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  64.97 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  64.97 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  62.76 
 
 		 203 aa  263  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  64.97 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  64.97 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  64.97 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  64.18 
 
 		 218 aa  262  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  64.97 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  66.5 
 
 		 204 aa  261  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  64.8 
 
 		 213 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  62.69 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  64.18 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  63.4 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1179  urease accessory protein UreG  61.93 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.585829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2840  urease accessory protein UreG  66.01 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  62.19 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1326  urease accessory protein UreG  67.01 
 
 		 205 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2849  urease accessory protein UreG  66.01 
 
 		 207 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2931  urease accessory protein UreG  66.01 
 
 		 207 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3469  urease accessory protein UreG  67 
 
 		 205 aa  258  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000202938  normal  0.193841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  67.01 
 
 		 205 aa  257  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  64.29 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  59.69 
 
 		 212 aa  256  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2421  urease accessory protein UreG  65.52 
 
 		 207 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  65.99 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  60.7 
 
 		 229 aa  254  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  59.28 
 
 		 203 aa  254  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  57.64 
 
 		 212 aa  254  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1030  urease accessory protein UreG  66.83 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7005  urease accessory protein UreG  64.04 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.896739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0998  urease accessory protein UreG  65.33 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  63.16 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  60.1 
 
 		 203 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  61.66 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  57.22 
 
 		 205 aa  245  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0830  urease accessory protein UreG  59.59 
 
 		 203 aa  245  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0885  urease accessory protein UreG  62.5 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0585  urease accessory protein UreG  64.47 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.084211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0964  urease accessory protein UreG  64.32 
 
 		 207 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0360581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2263  urease accessory protein UreG  65.99 
 
 		 213 aa  244  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.346179  normal  0.749182 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08871  urease accessory protein UreG  58.55 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2029  urease accessory protein  64.13 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2302  urease accessory protein UreG  63.04 
 
 		 224 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  61.58 
 
 		 201 aa  240  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>