40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1321 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  661    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  56.13 
 
 
313 aa  347  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  43.25 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  40.61 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  38.41 
 
 
336 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  38.91 
 
 
336 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  39.55 
 
 
313 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  38.49 
 
 
314 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  37.5 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  37.78 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  29 
 
 
350 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  30.48 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  29.21 
 
 
349 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  28 
 
 
356 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  28.84 
 
 
349 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  32.42 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  29.48 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  26.01 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  28.57 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  29.96 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  28.98 
 
 
371 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  33.05 
 
 
269 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  31.47 
 
 
255 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  31.25 
 
 
296 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  27.71 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  29.33 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  25.48 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  30 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  27.24 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  28.78 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  26.67 
 
 
1320 aa  59.7  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  36.26 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  32.63 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  28.95 
 
 
208 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.13 
 
 
226 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1167  hypothetical protein  28.03 
 
 
238 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  28.68 
 
 
550 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>