46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1940 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  99.14 
 
 
349 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  100 
 
 
349 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  56.16 
 
 
350 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  55.62 
 
 
356 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  54.31 
 
 
334 aa  352  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  52.78 
 
 
348 aa  350  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  50.77 
 
 
359 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  48.7 
 
 
328 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  35.57 
 
 
269 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  30.14 
 
 
371 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  31.88 
 
 
314 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  28.31 
 
 
300 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  30.86 
 
 
296 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  33.05 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  30.69 
 
 
288 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  32.68 
 
 
255 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  32.19 
 
 
313 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  32.39 
 
 
326 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  31.3 
 
 
314 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  31.74 
 
 
313 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  30.57 
 
 
315 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  30.71 
 
 
291 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  28.84 
 
 
325 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 
321 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 
312 aa  99.8  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  30.7 
 
 
292 aa  97.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  31.54 
 
 
288 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  33.06 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  29.83 
 
 
352 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  27.22 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  27.04 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  25.28 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  26.61 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  28.43 
 
 
1320 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  33.88 
 
 
226 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  30.65 
 
 
211 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  31.62 
 
 
208 aa  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  28.12 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  29.84 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  21.43 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  28.35 
 
 
218 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  21.43 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.8 
 
 
226 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  28 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  28 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.37 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>